Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ITGAEP38570 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITGAEP38570 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms