Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL4P36578 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL4P36578 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL4P36578 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL4P36578 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL4P36578 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms