Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA11P31270 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms