Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA6P31267 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA6P31267 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms