Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD10P28358 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD10P28358 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD10P28358 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms