Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PEX2P28328 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PEX2P28328 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PEX2P28328 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX2P28328 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX2P28328 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX2P28328 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms