Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTX3P26022 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTX3P26022 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTX3P26022 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTX3P26022 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTX3P26022 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTX3P26022 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTX3P26022 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTX3P26022 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTX3P26022 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTX3P26022 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms