Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPREP23469 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPREP23469 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPREP23469 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPREP23469 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPREP23469 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPREP23469 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPREP23469 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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