Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRDP23468 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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