Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRBP23467 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRBP23467 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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