Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NF1P21359 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NF1P21359 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NF1P21359 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NF1P21359 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NF1P21359 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NF1P21359 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NF1P21359 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms