Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFE3P19532 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFE3P19532 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFE3P19532 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFE3P19532 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFE3P19532 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFE3P19532 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFE3P19532 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFE3P19532 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms