Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT4P19013 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT4P19013 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT4P19013 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT4P19013 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT4P19013 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms