Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIG1P18858 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIG1P18858 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIG1P18858 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIG1P18858 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIG1P18858 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIG1P18858 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIG1P18858 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIG1P18858 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms