Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XBP1P17861 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XBP1P17861 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XBP1P17861 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XBP1P17861 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms