Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN2P17655 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN2P17655 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms