Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCG2P13521 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG2P13521 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG2P13521 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCG2P13521 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCG2P13521 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCG2P13521 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCG2P13521 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG2P13521 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms