Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VPREB1P12018 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms