Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms