Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD4P09016 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD4P09016 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD4P09016 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD4P09016 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD4P09016 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD4P09016 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD4P09016 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms