Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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