Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRCP08575 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
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