Protein–RNA interactions for Protein: P08456

CHO1, CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHO1P08456 PFF1YBR074W 2931 nt2.57□□□□□ -2
CHO1P08456 RGR1YLR071C 3249 nt2.57□□□□□ -2
CHO1P08456 BPT1YLL015W 4680 nt2.56□□□□□ -2
CHO1P08456 DYN2YDR424C 279 nt2.56□□□□□ -2
CHO1P08456 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.56□□□□□ -2
CHO1P08456 YPR197CYPR197C 564 nt2.56□□□□□ -2
CHO1P08456 ECM25YJL201W 1800 nt2.56□□□□□ -2
CHO1P08456 YDR250CYDR250C 276 nt2.55□□□□□ -2
CHO1P08456 HPA3YEL066W 540 nt2.55□□□□□ -2
CHO1P08456 YPL185WYPL185W 396 nt2.55□□□□□ -2
CHO1P08456 NAB3YPL190C 2409 nt2.55□□□□□ -2
CHO1P08456 snR42snR42 351 nt2.55□□□□□ -2
CHO1P08456 GYP7YDL234C 2241 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 DBP7YKR024C 2229 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 SSE1YPL106C 2082 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 SNX41YDR425W 1878 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 DIE2YGR227W 1578 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 snR76snR76 109 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 HYR1YIR037W 492 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 YJR011CYJR011C 786 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 PET191YJR034W 327 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 YOR105WYOR105W 327 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 BRO1YPL084W 2535 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 RIF1YBR275C 5751 nt2.54□□□□□ -2
CHO1P08456 FUN30YAL019W 3396 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 GCD10YNL062C 1437 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 YPK1YKL126W 2043 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 ECM21YBL101C 3354 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 RPS24BYIL069C 408 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 LCL2YLR104W 396 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 YJL016WYJL016W 1686 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 RGC1YPR115W 3252 nt2.53□□□□□ -2
CHO1P08456 DNL4YOR005C 2835 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 CDC20YGL116W 1833 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 NPR3YHL023C 3441 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YDL068WYDL068W 330 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 PNC1YGL037C 651 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RPL20AYMR242C 519 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RPL33AYPL143W 324 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 MGR1YCL044C 1254 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 PSO2YMR137C 1986 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 GNT1YOR320C 1476 nt2.52□□□□□ -2.01
CHO1P08456 ILS1YBL076C 3219 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 TCB2YNL087W 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 TPS2YDR074W 2691 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YKR033CYKR033C 426 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YLR434CYLR434C 384 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 ICY1YMR195W 384 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 COX7YMR256C 183 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 MKT1YNL085W 2493 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YGR067CYGR067C 2415 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 DUG2YBR281C 2637 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 PRP8YHR165C 7242 nt2.51□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RTT10YPL183C 3042 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 TLC1TLC1 1301 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 ESL1YIL151C 3357 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 SEC22YLR268W 645 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 TRM7YBR061C 933 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YBR197CYBR197C 654 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RPA190YOR341W 4995 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 DYN1YKR054C 12279 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 GCV2YMR189W 3105 nt2.5□□□□□ -2.01
CHO1P08456 MSS11YMR164C 2277 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YIL174WYIL174W 228 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RPS22AYJL190C 393 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RAM2YKL019W 951 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YML003WYML003W 873 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 MRPL50YNR022C 420 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 SPC72YAL047C 1869 nt2.49□□□□□ -2.01
CHO1P08456 IKI3YLR384C 4050 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 NUP82YJL061W 2142 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 ROG1YGL144C 2058 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 SKT5YBL061C 2091 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 PAU10YDR542W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 PAU11YGL261C 363 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 PAU4YLR461W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RGM1YMR182C 636 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 RPL25YOL127W 429 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 ATP15YPL271W 189 nt2.48□□□□□ -2.01
CHO1P08456 SRB8YCR081W 4284 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 STE6YKL209C 3873 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 GPI14YJR013W 1212 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YLR458WYLR458W 381 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 SMA2YML066C 1110 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 YOR121CYOR121C 306 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 KSP1YHR082C 3090 nt2.47□□□□□ -2.01
CHO1P08456 BCK1YJL095W 4437 nt2.46□□□□□ -2.02
CHO1P08456 ORC1YML065W 2745 nt2.46□□□□□ -2.02
CHO1P08456 AAD16YFL057C 459 nt2.46□□□□□ -2.02
CHO1P08456 YGR035CYGR035C 351 nt2.46□□□□□ -2.02
CHO1P08456 YGR107WYGR107W 450 nt2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103.6 ms