Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB1P08034 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB1P08034 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB1P08034 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms