Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA4P06727 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA4P06727 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA4P06727 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOA4P06727 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOA4P06727 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA4P06727 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA4P06727 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms