Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYBBP04839 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYBBP04839 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYBBP04839 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CYBBP04839 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYBBP04839 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYBBP04839 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYBBP04839 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms