Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX18O95935 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX18O95935 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX18O95935 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX18O95935 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TBX18O95935 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TBX18O95935 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TBX18O95935 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX18O95935 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX18O95935 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms