Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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VEGFDO43915 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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