Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COCHO43405 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COCHO43405 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COCHO43405 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COCHO43405 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COCHO43405 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms