Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APAF1O14727 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APAF1O14727 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms