Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRTO14522 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
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