Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCER2I3L3R5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms