Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA8SH3BPF8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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