Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
E9PCH4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
E9PCH4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
E9PCH4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
E9PCH4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
E9PCH4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
E9PCH4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E9PCH4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E9PCH4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E9PCH4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E9PCH4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
E9PCH4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
E9PCH4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
E9PCH4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
E9PCH4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
E9PCH4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
E9PCH4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
E9PCH4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
E9PCH4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E9PCH4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
E9PCH4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
E9PCH4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
E9PCH4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
E9PCH4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
E9PCH4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
E9PCH4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms