Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLRF2D3W0D1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLRF2D3W0D1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms