Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF3BA8MYP8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms