Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3P2A8K0S8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms