Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SOBPA7XYQ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOBPA7XYQ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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