Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC160A6NGH7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms