Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6BA6NDN3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms