Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMD3A2A2Y4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD3A2A2Y4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms