Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A0D9SFI3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms