Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM9Q9Y5J7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms