Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAD54L2Q9Y4B4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAD54L2Q9Y4B4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAD54L2Q9Y4B4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms