Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFE2L3Q9Y4A8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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