Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms