Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG5Q9UPR3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG5Q9UPR3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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