Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH7Q9ULB5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH7Q9ULB5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms