Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms