Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms